Phomopsis sclerotioides peut être responsable d'altérations et anomalies des racines.

 

Ce champignon du sol est particulièrement grave sur concombre, il s'attaque aussi au melon et à son porte-greffe Benincasa cerifera. Surtout inféodé aux zones de production situées dans la moitié nord de la France, il semble depuis quelques années s'installer dans les zones méridionales. Il engendre une pourriture plus ou moins humide des racines qui  disparaissent en partie ultérieurement. Son identification est assez délicate bien que l'on puisse observer sur les racines des structures très caractéristiques. Pour les voir, il convient d'arracher délicatement plusieurs systèmes racinaires et de les observer très attentivement.